在自然界裡想找細菌，最容易就是往泥土裡找——每一克泥土裡可以住了十億個細菌！也因此，城市人對泥土的觀感往往是「很污糟（骯髒）」，因為「好多菌（細菌）」。正如上回提及，大部份細菌對人類無害。再準確一點說，若果沒了細菌，人類其實無法生存。
泥土中的細菌在自然界裡擔當幾個重要角色：
1) 將大氣中的氮氣轉化為生物可用的氮化合物；
2) 將有機物質分解成為無機的養份，使養份回歸土壤；
3) 在有機物的分解過程中將儲存在生物中的碳重新釋放至大氣中，例如產生二氧化碳。
上述三點均確保自然中的養份得以循環再用，植物可獲得足夠的原材料繼續生長，提供食物給地球上所有生物，以至調節地球氣候，使地球維持適合生物居住的狀況。
與細菌做朋友，除了上回提及的環保酵素，還可以透過堆肥形式處理廚餘。堆肥一般給人的印象不太好，例如會有強烈異味及會引來很多不討好的昆蟲，恍惚變成衛生問題。原因是因為最基本的堆肥製作是將廚餘放在密封容器內，任由它自行腐化。然而在密封環境，附在廚餘上的細菌沒有足夠氧氣使用，在缺氧環境下進行有機物分解，往往會產生一些味道強烈的副產品，而昆蟲也是隨著這些氣味而來。
然而若我們模仿大自然中屍體在泥中腐化的情況，將廚餘與泥土混合來製作堆肥，一方面提供了足夠的細菌加快分解作用，也令分解期間產生的液體能被泥土吸收，減少異味產生。只要將泥土與廚餘以15至20比1的比例混合，放置在陰暗而通風的地方，約一至兩個月時間，廚餘就能被分解。適合的溫度和濕度有助細菌生存，可加速廚餘分解。
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